ドメイン登録代行業者とレンタルサーバーって密接な関係があるんです。
実際、ほとんどのドメイン登録代行業者はレンタルサーバー会社が運営しているか、
レンタルサーバーと提携しています。

別に、ドメイン持ち込みに対応したレンタルサーバーであれば、
どのドメイン登録代行業者で取ったドメインでも使うことができるのですが、

提携しているところで使ったほうが、
設定が楽だったり、付加サービスがあったり、サポートしてもらいやすかったりと、
メリットがありますから、ドメイン登録代行業者を選ぶときには、
必ずレンタルサーバーの性能も考慮にいれるようにしたほうがいいです。

また、レンタルサーバーはドメイン登録代行業者に比べ、当たりはずれが大きく
ホームページを実に来てくれた人に直接影響が出ることもありますので、
レンタルサーバーの性能でドメイン登録代行業者を決めてしまうくらいでもかまいません。